Fastlandet brukar delas in i tre huvudregioner: kustlandet vid Stilla havet, ett regnskogsbevuxet lågland i öster, och däremellan höglandet som är en del av bergskedjan Anderna. Cirka 100 mil ut i Stilla havet ligger Galápagosöarna som hör till Ecuador.
Klimatet är huvudsakligen tropiskt men varierar med höjden över havet.
Ecuador ligger i en seismiskt aktiv region, med runt 100 vulkaner i landets andel av Anderna. Vulkanutbrott och jordbävningar förorsakar emellanåt katastrofer.
Massiva regn förekommer i stora delar av landet under regnperioden och kan orska skador bland annat på infrastruktur och gör vägarna svårframkomliga i perioder.
Ecuador drabbas ibland hårt av El Niño, ett väderfenomen i Stillahavsområdet som uppträder med några års mellanrum och orsakar stora störningar med bland annat översvämningar som följd.
