大使館は1959年にスウェーデンの代表団からスウェーデン政府が不動産を譲渡されて以来、同じ場所に立地しています。
現在の大使館の建物は建築家のミカエル・グラニートが太陽の動きから発想を得て設計したものです。現大使館は1991年に落成し、館内には大使館のそれぞれの部署、ビジネス・スウェーデンの事務所および在日スウェーデン商工会議所（SCCJ）がありました。
現在、スウェーデン大使館は改修工事の為、仮事務所（東京都港区赤坂1-12-32アーク森ビル16階）に移転していますが、2026年に改修工事は完了予定です。