Sverige har en lång historia av samarbete med Sydafrika, Botswana och Namibia. Samarbetet har utvecklats från ett omfattande stöd till antiapartheidrörelsen och traditionellt utvecklingsbistånd till ett bredare partnerskap som bygger på gemensamma intressen, ömsesidigt ansvar och samarbete kring globala och regionala utmaningar.
Sedan det bilaterala utvecklingssamarbetet med Sydafrika fasades ut 2013, bedrivs det svenska utvecklingssamarbete med landet främst inom ramen för regionala och tematiska strategier. Flera av Sveriges samarbetspartners har sina huvudkontor eller regionala kontor i Sydafrika, vilket gör landet till en viktig plattform för genomförandet av svenskt utvecklingssamarbete i regionen.
Ambassaden i Pretoria ansvarar för att genomföra av Sveriges Strategin för sexuell och reproduktiv hälsa och rättigheter (SRHR) i Afrika 2022-2026. Strategin syftar till att stärka människors rätt till sexuell reproduktiv hälsa och rättigheter samt bidra till ökad jämställdhet och minskad diskriminering i regionen.